박테리아 게놈의 전체 게놈 시퀀싱 - 도구 및 애플리케이션

상품 설명

이 과정은 의료 분야에서 점점 더 관련성이 높아지고 있는 박테리아 게놈의 전체 게놈 시퀀싱(WGS) 주제를 다룰 것입니다. WGS 기술 및 응용 프로그램은 고전적인 방법이 WGS 기술로 대체되고 있으므로 이 분야에서 일하는 사람들이 데이터를 분석하고 해석할 수 있는 결과를 얻을 수 있도록 하는 데 생물 정보 도구가 매우 중요하기 때문에 국제 정치 의제가 높습니다. 다양한 용도로 사용됩니다. 이 과정은 학습자에게 플라스미드 특성화뿐만 아니라 항균 저항성 및 독성 특성의 종 식별, 유형화 및 특성화를 포함하여 박테리아 감시에서 WGS 응용 프로그램을 이해하고 숙지할 수 있는 기초를 제공합니다. 또한 무료로 사용 가능한 WGS 분석 도구를 사용하여 학습자가 해결할 수 있는 이러한 도구 및 연습 중 일부를 사용하는 방법에 대한 데모를 통해 학습자가 온라인 도구와 도구를 사용할 수 있는 방법에 대해 배울 수 있는 기회를 제공합니다.

이 과정이 끝나면 다음을 수행 할 수 있어야합니다.

1. 세균 분류의 일반원칙을 설명하시오.
2. 전체 게놈 시퀀싱을 세균성 병원체 및 항균제 내성 감시에 적용한 예를 제시하십시오.
3. 하위 분류 및 감시를 위한 게놈 도구 적용
4. Next-Generation Sequencing의 개념 정의 및 NGS의 Sequencing 데이터 설명
5. 원시 읽기에서 contig로 de novo 어셈블리를 수행하는 방법 설명
6. 종 식별, MLST 분류 및 저항성 유전자 검출을 위한 도구 뒤에 있는 방법을 열거합니다.
7. 다른 박테리아 및 병원체 게놈의 실제 사례에서 종 식별, MLST 유형 지정 및 저항성 유전자 검출을 위한 도구를 적용합니다.
8. Salmonella 및 E.coli 타이핑, 플라스미드 레플리콘 검출 및 플라스미드 타이핑을 위한 도구 뒤에 숨겨진 방법을 설명하십시오.
9. 다른 박테리아 및 병원체 게놈의 실제 사례에서 Salmonella 및 E.coli 타이핑, 플라스미드 레플리콘 검출 및 플라스미드 타이핑을 위한 도구를 활용합니다.
10. 게놈 데이터의 일괄 분석 및 유형화를 위해 개념을 설명하고 통합 세균 분석 파이프라인을 사용할 수 있습니다.
11. SNP 기반 계통수 구축 방법 시연
12. 계통발생수를 구축하기 위해 계통발생학적 도구를 적용하고 박테리아 또는 병원균 균주의 관련성을 설명합니다.
13. 고유한 시퀀스 데이터베이스를 만드는 방법 설명
14. MyDbFinder 도구를 활용하여 전체 게놈 시퀀싱에서 관심 유전자 마커를 감지합니다.